Năm 2009, Hội Nông dân tỉnh đã phối hợp tổ chức cho 100 cán bộ Hội Nông dân các cấp trong tỉnh tập huấn nghiệp vụ công tác Hội và công tác phối hợp liên ngành; đã tổ chức triển khai học tập quán triệt Nghị quyết, Chương trình hành động thực Nghị quyết Đại hội lần thứ V Hội Nông dân Việt Nam, Đại hội lần thứ XIV Hội Nông dân tỉnh; tổ chức hội nghị triển khai nội dung thi đua. Ban Kiểm tra tỉnh Hội đề ra nội dung chương trình, kế hoạch công tác kiểm tra cụ thể từng quý và có hướng dẫn cơ sở thực hiện. Qua kết quả kiểm tra có 100% cơ sở Hội triển khai thực hiện.

Ban Kiểm tra Hội nông dân tỉnh tổ chức các đợt kiểm tra ở 11 huyện, thành Hội và cơ sở như: kiểm tra quy chế hoạt động; chương trình toàn khóa; chương trình hành động thực hiện Nghị quyết của BCH Hội Nông dân các huyện, thành phố (nhiệm kỳ 2007 - 2012); kiểm tra các hoạt động chào mừng kỷ niệm 79 năm ngày thành lập Hội Nông dân Việt Nam, kết quả tổ chức cuộc vân động “Học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh”; kiểm tra tình hình triển khai, thực hiện và sơ kết 9 năm thực hiện Chỉ thị 59 của Bộ chính trị tại 11 huyện, thành phố; tình hình triển khai và thực hiện Chỉ thị 26/TTg và Công văn số 1502/TTg ở các huyện, thành Hội; tình hình, triển khai tổ chức Đại hội Chi Hội ở cơ sở; kiểm tra công tác Hội và phong trào nông dân, các chỉ tiêu thi đua, kiểm tra việc thực hiện và sử dụng các nguồn vốn, quỹ tại cơ sở.

Ngoài ra Ban Kiểm tra tỉnh Hội còn kiểm tra các chuyên đề như: kiểm tra tiến độ xây dựng Trung tâm dạy nghề và HTND, kiểm tra lớp Trung cấp Nông nghiệp của cán bộ Hội cơ sở, kiểm tra tình hình sản xuất của nông dân, kiểm tra việc làm đời sống của những hộ nông dân mất đất sản xuất do quy hoạch xây dựng các khu, cụm, công nghiệp, thị tứ, khu dân cư và kiểm tra việc thực hiện quy chế dân chủ ở cơ sở.

Tại các huyện, thành Hội và cơ sở đã tổ chức được 1.894 cuộc kiểm tra (tỉnh 72 cuộc, huyện 326 cuộc, xã 1.496 cuộc), các huyện làm tốt công tác kiểm tra như: An Nhơn, Phù Mỹ, Phù Cát, Quy Nhơn, Hoài Nhơn, Vĩnh Thạnh, Tuy phước, An lão và Hoài Ân. Thông qua công tác kiểm tra đã giúp BTV Hội các cấp kịp thời nắm bắt tình hình hoạt động của Hội, các phong trào và đời sống kinh tế xã hội, tâm tư nguyện vọng của cán bộ, hội viên, nông dân ở nông thôn để chỉ đạo sát thực tế, đồng thời tham mưu cho cấp ủy, chính quyền có những chủ trương sát đúng hợp lòng dân.

Năm 2009, Hội phối hợp với các ngành chức năng triển khai thực hiện Chỉ thị 26/TTg và công văn số 1502 của Thủ tướng Chính phủ  với kết quả từ đầu năm đến nay các cấp Hội đã hòa giải thành trên 1240 vụ, đã tham gia cùng chính quyền tiếp hàng ngàn lượt dân ở các địa phương. Trong đó, tại trụ sở tiếp dân của tỉnh 146 lượt; ở 11 huyện, thành phố 1083 lượt; xã phường 269 lượt. Quá trình giải quyết khiếu nại, tố cáo của nông dân, nhiều nơi UBND tham khảo ý kiến của Hội Nông dân trước khi ra quyết định giải quyết và giao cho các cơ quan chức năng phối hợp cùng Hội Nông dân vận động, thuyết phục nông dân có khiếu kiện thực hiện các quyết định đúng của cấp có thẩm quyền. Điển hình như vụ khiếu kiện của cán bộ, nhân dân thôn Lộ Diêu, xã Hoài Mỹ, Hoài Nhơn; Mỹ Thành, Mỹ Thọ huyện Phù Mỹ. Riêng Hội Nông dân tỉnh đã tiếp nhận 6 đơn thư khiếu nại của nông dân liên quan đến tranh chấp đất đai và bồi thường giải phóng mặt bằng, Hội đã trực tiếp phối hợp với các cơ quan chức năng giải quyết kịp thời.